Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ptchd1Q14B62 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ptchd1Q14B62 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ptchd1Q14B62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ptchd1Q14B62 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ptchd1Q14B62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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