Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd2Q149F1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 533.9 ms