Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim24Q0VG18 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms