Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ttc39dQ0VF76 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc39dQ0VF76 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ttc39dQ0VF76 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ttc39dQ0VF76 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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