Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms