Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms