Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pglyrp4Q0VB07 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms