Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms