Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd8Q09XV5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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