Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms