Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssrp1Q08943 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms