Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnma1Q08460 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms