Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calb2Q08331 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms