Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms