Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ebf1Q07802 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ebf1Q07802 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms