Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a2Q07643 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms