Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col17a1Q07563 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col17a1Q07563 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms