Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms