Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf9Q07105 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms