Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms