Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms