Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Caprin2Q05A80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms