Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a1Q05722 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms