Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcn1Q05186 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms