Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk18Q04899 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms