Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms