Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emx2Q04744 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms