Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scg2Q03517 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scg2Q03517 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms