Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col6a2Q02788 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms