Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pax5Q02650 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pax5Q02650 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms