Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col1a2Q01149 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col1a2Q01149 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms