Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp1Q00915 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms