Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SeleQ00690 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SeleQ00690 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SeleQ00690 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeleQ00690 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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