Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms