Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F8a1Q00558 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8a1Q00558 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms