Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms