Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cry1P97784 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cry1P97784 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cry1P97784 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms