Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms