Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf1P84078 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Arf1P84078 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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