Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpcaP84075 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpcaP84075 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms