Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfbiP82198 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms