Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms