Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Otx1P80205 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms