Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms