Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb1P70662 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms