Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msx3P70354 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms