Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms