Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtgdrP70263 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtgdrP70263 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms