Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba4aP68368 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tuba4aP68368 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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