Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tra2bP62996 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2bP62996 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms